Willi Marquardt begann seinen Dienst bei der Stasi im Alter von 27 Jahren bei der Bezirksverwaltung Rostock. Schon nach neun Monaten wurde Marquardt 1958 in die Hauptabteilung V (die spätere HA XX) nach Berlin versetzt.
Die meiste Zeit arbeitete er im Referat 2 der HA XX und in den Bereichen zur Überwachung der Jugend und Kultur. Im Zuge dieser Tätigkeit leitete er auch den Überwachungsvorgang „Kopernikus“ gegen Gilbert Radulovic.
Aus Marquardts Kaderakte (Personalakte) geht hervor, dass er der HA XX bis zum Ende seiner Laufbahn treu blieb. Selbst als sein Zuständigkeitsbereich einer anderen Abteilung zufiel, arbeitete der mittlerweile zum Major beförderte Marquardt bis zu seiner Verrentung 1988 in der Poststelle der HA XX.
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